يحتوي قسم هندسة المعالجة في سامرف على 4 اقسام: الأقسام الثلاثة الأولى تمثل المنطقة الرئيسية وهي تقع تحت اشراف إدارة العمليات، أما القسم الرابع فيتعلق بتصميم مشاريع هندسة المعالجة.
- المنطقة "أ": في هذه المنطقة يقدم مهندسو المعالجة الدعم الفني للوحدات التالية: وحدة تقطير الزيت الخام ووحدة التقطير الفراغي ووحدة خفض اللزوجة ووحدة معالجة الديزل بالهيدروجين ووحدة معالجة النافثا ووحدة تكسير السوائل بالمحفز الكيميائي ووحدة فصل الغاز المشبع ووحدة الأزمرة ووحدة تجزئة البيوتان.
- المنطقة "ب": في هذه المنطقة يقدم مهندسو المعالجة الدعم الفني للوحدات التالية: وحدة تكسير السوائل بالمحفز الكيميائي ووحدة الألكلة ووحدة ميثايل ثلاثي بيوتايل الأثير ووحدة فصل الغاز غير المشبع ووحدة استخلاص الكبريت.
- المنطقة "ج": في هذه المنطقة يقدم مهندسو المعالجة الدعم الفني للوحدات التالية: المرافق والغلايات وخارج الموقع والبيئة وميناء الزيت.
- تصميم مشاريع هندسة المعالجة: تم إضافة هذا القسم الجديد إلى قسم هندسة المعالجة لتوفير التقييم المباشر والمتابعة الفنية المستمرة لبعض المشاريع الرئيسية الكبيرة التي تخطط المصفاة لانشائها خلال الصيانة الدورية عام 2006. ويستفيد القسم حالياً من خبرة اختصاصي من شركة اكسون موبيل لإقرار نطاق المشروع وتقييم الخيارات المتاحة للمعدات المختارة التي سيتم تركيبها استناداً على توصية المقاول. وتجري الاستفادة من نماذج المشروع الثاني إضافة إلى الخبرة الفنية للاختصاصي ومعرفته بمبادئ التصميم في اكسون موبيل لتحقيق هذا الهدف.
